AquaGen:深度解析基于生成模型的高分辨率分子动力学自由能计算
AquaGen是首个全原子、显式溶剂、周期性边界条件感知的生成模型,能以分子动力学(MD)成本的一小部分生成玻尔兹曼分布构型,实现了MD级别的绝对水合自由能(AHFE)精度与4-10倍的速度提升。
AquaGen是首个全原子、显式溶剂、周期性边界条件感知的生成模型,能以分子动力学(MD)成本的一小部分生成玻尔兹曼分布构型,实现了MD级别的绝对水合自由能(AHFE)精度与4-10倍的速度提升。
本文深度解析了多伦多大学 Alán Aspuru-Guzik 团队的最新力作 CLARI,这是一种基于单晶胞流匹配(Flow Matching)与纯双偏置注意力机制(Pair-Bias Attention)的高效有机晶体预测生成模型。