AquaGen:深度解析基于生成模型的高分辨率分子动力学自由能计算
AquaGen是首个全原子、显式溶剂、周期性边界条件感知的生成模型,能以分子动力学(MD)成本的一小部分生成玻尔兹曼分布构型,实现了MD级别的绝对水合自由能(AHFE)精度与4-10倍的速度提升。
AquaGen是首个全原子、显式溶剂、周期性边界条件感知的生成模型,能以分子动力学(MD)成本的一小部分生成玻尔兹曼分布构型,实现了MD级别的绝对水合自由能(AHFE)精度与4-10倍的速度提升。
本研究引入了一个创新的计算工作流,将长时程分子动力学与高通量量子力学分析相结合,揭示了远端突变对 HIV-1 蛋白酶中药物达芦那韦结合影响的电子结构特征,并展示了异构超算在此类复杂生物物理机制研究中的强大潜力。